SDN Serayu yang berdiri sejak tahun 1947 dikenal oleh masyarakat sebagai sekolah unggul di kota Yogyakarta telah banyak meraih prestasi dan keunggulan yang tidak dapat kami tuliskan satu persatu. Berikut berbagai penghargaan yang diberikan oleh pemerintah dalam 1 Dasawarsa terakhir :
- Sekolah Dasar PAI Model propinsi DIY
- SD Pilot Proyek Bahasa Inggris Nasional
- SD Bilingual Nasional untuk Sains dan Matematika
- SD Pembelajaran Penjas Propinsi DIY
- SD Koalisi Nasional Regional
- SD Pilot Project Kurikulum 2013 Nasional
- Pilot Project Sekolah Kebugaran Jasmani
- Juara 3 Kantin Sehat Tingkat Kecamatan Gondokusuman Tahun 2015
- Sekolah Model Unggulan Mutu Pendidikan DIY Tahun 2016
- Sekolah ADIWIYATA KOTA TAHUN 2014
- Sekolah ADIWIYATA PROPINSI TAHUN 2015
- Sekolah ADIWIYATA NASIONAL TAHUN 2016
- Menuju Sekolah ADIWIYATA MANDIRI Tahun 2018